2285年，在與可汗的戰(zhàn)斗中損壞的聯(lián)邦星艦進取號，返回了地球的太空港以進行維修。柯克還在為斯波克的死感到悲傷。麥科伊醫(yī)生出現(xiàn)了種種異常的行為：如擅自闖入被封鎖的斯波克原來的艙房、胡言亂語等，最后他被送進了醫(yī)院進行精神檢查。斯科提被另分派到了聯(lián)邦星艦精進號。星際艦隊指揮部對新形成的創(chuàng)世星下達了禁入令。柯克被告知，進取號即將除役。      ...

一艘巨大的外星無人探測器向地球航來，它不斷地發(fā)出奇特的電波信號：功率強大的信號煮沸了海水，干擾了附近的星艦并造成了廣泛的破壞。此時，詹姆斯·柯克中將與他的船員們在完成了讓斯波克上校復活的任務后，駕駛著從克林貢人那搶來的猛禽艦（被改名為“賞金號”）從瓦肯星返航，盡管他們已經(jīng)知道了將面臨軍事法庭的指控：他們被指控盜竊了聯(lián)邦星艦進取號，并對她的毀壞負有責任。在此關頭，尚在恢復中的斯波克發(fā)現(xiàn)這艘外星探測器...